dnaman是一款功能非常強(qiáng)大的分子生物學(xué)綜合序列分析軟件。dnaman可以讓您在進(jìn)行復(fù)雜運(yùn)算以及模擬DNA運(yùn)行狀態(tài)的過(guò)程中擁有一個(gè)可以完美搭載您數(shù)據(jù)計(jì)算的平臺(tái)。dnaman支持的分析類型非常豐富，包括蛋白質(zhì)分析、分子研究、引物分析、序列對(duì)比研究等模塊，讓您在研究生物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的時(shí)候更加方便。歡迎大家來(lái)下載體驗(yàn)！

【功能介紹】

　　1、兩個(gè)引物互補(bǔ)

　　您可以使用DNAMAN檢查兩個(gè)寡核苷酸序列的互補(bǔ)性。要執(zhí)行此功能，第二個(gè)引物應(yīng)通過(guò)選擇引物|載入DNAMAN存儲(chǔ)器兩個(gè)Primer互補(bǔ)命令。

　　DNAMAN搜索兩個(gè)引物之間的互補(bǔ)序列，結(jié)果表明兩個(gè)引物之間的連續(xù)和不連續(xù)的互補(bǔ)序列。

　　2、PCR引物設(shè)計(jì)

　　您可以使用DNAMAN選擇滿足您擴(kuò)增模板DNA要求的PCR引物。設(shè)計(jì)了許多參數(shù)來(lái)篩選PCR引物，例如PCR產(chǎn)物大小，引物長(zhǎng)度，Tm，GC組成和鹽濃度的范圍。其他參數(shù)用于排除“低質(zhì)量”引物。

　　3、導(dǎo)入和導(dǎo)出記錄

　　從文本文件導(dǎo)入記錄

　　從文本文件導(dǎo)入寡核苷酸序列是將大量oligo記錄添加到數(shù)據(jù)庫(kù)的便捷工具。

　　DNAMAN將記錄的信息列入七個(gè)字段：名稱，來(lái)源，備注，長(zhǎng)度，GC含量，熔解溫度和序列。如果數(shù)據(jù)庫(kù)中有大量記錄，則可以使用前四個(gè)字段作為排序鍵，以便在“記錄列表”框中選擇性地顯示記錄。

　　4、導(dǎo)向不匹配

　　定向錯(cuò)配可以通過(guò)在突變附近的位點(diǎn)引入單次或雙重錯(cuò)配來(lái)創(chuàng)建或去除當(dāng)前DNA序列或其變體上的限制性位點(diǎn)。使用此功能，您可以創(chuàng)建或破壞限制性位點(diǎn)，以區(qū)分野生型等位基因與常見(jiàn)突變體等位基因?！?/p>

【軟件特色】

　　1、掃描序列的相似性

　　DNAMAN掃描所有的序列記錄在默認(rèn)的數(shù)據(jù)庫(kù)搜索當(dāng)前序列的同源序列。如果默認(rèn)數(shù)據(jù)庫(kù)包含DNA序列，則默認(rèn)序列必須是DNA序列。如果默認(rèn)數(shù)據(jù)庫(kù)包含蛋白質(zhì)序列，則默認(rèn)序列必須是蛋白質(zhì)序列。DNAMAN將使用快速對(duì)準(zhǔn)方法掃描數(shù)據(jù)庫(kù)的序列相似性。您可以選擇對(duì)結(jié)果的最終輸出使用快速對(duì)齊或最佳對(duì)齊方式。

　　2、編輯記錄信息

　　有關(guān)特定記錄的信息可以編輯。在序列列表框中，所有記錄按字母順序或記錄順序列出。每個(gè)記錄名字的數(shù)量顯示記錄的記錄號(hào)ID.用DNAMAN自動(dòng)分配。因此，您可以為不同的記錄使用相同的名稱。

　　3、DNA和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)

　　DNAMAN軟件的數(shù)據(jù)庫(kù)功能，允許用戶組織DNA和蛋白質(zhì)序列的不同科目。

　　4、數(shù)據(jù)庫(kù)管理

　　選擇數(shù)據(jù)庫(kù)|經(jīng)理命令打開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)管理器”對(duì)話框。

　　5、錯(cuò)配分析

　　錯(cuò)配分析的目的是找到所有可能的退火位點(diǎn)的DNA序列的引物在默認(rèn)。此功能可用于PCR和DNA測(cè)序的引物選擇。權(quán)重矩陣用來(lái)區(qū)分引物位置的重要性。由于引物在3’末端對(duì)目標(biāo)DNA的匹配比PCR擴(kuò)增的5末端更重要，所以更多的權(quán)重被賦予3’末端。為了提高PCR引物的特異性，應(yīng)始終檢查引物與靶DNA之間是否存在次級(jí)退火位點(diǎn)。