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Beacon Designer是一款功能強(qiáng)大的引物設(shè)計(jì)軟件,能夠幫助用戶輕松建立核苷酸分析、NDA分析等項(xiàng)目,為用戶的引物分析工作提供了幫助。因?yàn)檐浖樵囉糜袝r間時間限制,所以小編為大家找來了軟件的破解版,安裝完成即為正式版。
1、FRET探針
FRET探針-設(shè)計(jì)出不含二聚體,重復(fù)序列和運(yùn)行序列的最佳FRET探針,以確保信號保真度。
多重FRET探針和引物-檢查FRET探針是否與所有引物交叉雜交,以防止多重反應(yīng)競爭。
評估預(yù)先設(shè)計(jì)的FRET探針和引物-允許使用SYBR®green引物設(shè)計(jì)最佳的FRET探針。
算法-使用高度精確的SantaLucia最近鄰居計(jì)算Tm熱力學(xué)值。
圖形視圖-顯示探針二級結(jié)構(gòu)的圖形視圖。
2、Scorpions®底漆設(shè)計(jì)
Scorpions®Primer-設(shè)計(jì)最佳的標(biāo)準(zhǔn)引物,Scorpions®引物,Probe和Scorpions®,不含二聚體,重復(fù)序列和運(yùn)行序列,可確保信號保真度。
等位基因識別-設(shè)計(jì)Scorpions®來檢測野生和突變等位基因。
MultiplexScorpions®和引物-檢查Scorpions®是否具有交叉同源性,所有引物可防止多重反應(yīng)競爭。
預(yù)先設(shè)計(jì)的Scorpions®引物-允許使用預(yù)先設(shè)計(jì)的探針/引物來設(shè)計(jì)最佳引物/探針和蝎子。
Tm計(jì)算-高精度發(fā)夾Tm計(jì)算。
圖形視圖-顯示設(shè)計(jì)的Scorpions®Primer的圖形視圖。
3、底漆設(shè)計(jì)
設(shè)計(jì)引物-設(shè)計(jì)針對SYBR®Green / Beacon /TaqMan®/ FRET /Scorpions®/ HRMA應(yīng)用優(yōu)化的引物對。
算法-使用高度精確的SantaLucia最近鄰居熱力學(xué)值計(jì)算引物Tm。
引物等級-根據(jù)引物效率對引物進(jìn)行排名。根據(jù)引物的熱力學(xué)性質(zhì)和二級結(jié)構(gòu)篩選綜合標(biāo)準(zhǔn)引物。
自動引物多路復(fù)用-檢查引物池中的同源性,以減少引物二聚體。
預(yù)先設(shè)計(jì)的引物-允許將先前設(shè)計(jì)的引物用于信標(biāo),TaqMan®,F(xiàn)RET,HRMA和SYBR®Green分析。
避免模板的二級結(jié)構(gòu)-設(shè)計(jì)引物時自動避免模板中的二級結(jié)構(gòu)。
避免交叉同源性-通過自動避免使用BLAST發(fā)現(xiàn)的同源性來確保信號保真度。
引物擴(kuò)增子和探針BLAST搜索-BLAST搜索引物,擴(kuò)增子和探針以驗(yàn)證設(shè)計(jì)的特異性。
SNP擴(kuò)增用于信標(biāo),TaqMan®,F(xiàn)RET和HRMA化學(xué)試劑的引物旨在擴(kuò)增SNP。 SYBR®Green引物的設(shè)計(jì)應(yīng)使區(qū)分等位基因的核苷酸位于其中一種引物的3'末端堿基處??梢詫RMA分析設(shè)計(jì)為擴(kuò)增SNP和所有其他類型的突變,例如取代,缺失,插入等。
一致的條件-運(yùn)行中的所有引物均針對相同的PCR反應(yīng)條件進(jìn)行了優(yōu)化。
4、爆炸搜索
選擇性cDNA擴(kuò)增-通過設(shè)計(jì)跨外顯子/外顯子和外顯子-內(nèi)含子邊界的引物來避免gDNA污染。外顯子區(qū)域通過解釋GenBank標(biāo)頭注釋來識別。也可以手動指定它們。
BLAST搜索-BLAST搜索整個序列,設(shè)計(jì)引物和擴(kuò)增子以顯現(xiàn)特異性。
BLAST數(shù)據(jù)庫-使用獨(dú)立的BLAST搜索本地自定義數(shù)據(jù)庫,或直接連接到NCBI服務(wù)器以獲取公共數(shù)據(jù)庫。
重復(fù)和低復(fù)雜度區(qū)域-優(yōu)化BLAST搜索參數(shù)以在搜索NCBI可用的基因組數(shù)據(jù)庫時檢測重復(fù)和低復(fù)雜度區(qū)域。
BLAST結(jié)果視圖-提供在序列,引物對,擴(kuò)增子和探針上搜索BLAST的結(jié)果視圖。
5、數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)管理
設(shè)計(jì)模式-Beacon和TaqMan®設(shè)計(jì)位于不同的模塊中:允許在運(yùn)行時進(jìn)行模式切換。
項(xiàng)目-創(chuàng)建多個項(xiàng)目。通過為每個實(shí)驗(yàn)創(chuàng)建單獨(dú)的項(xiàng)目,可以輕松管理多個實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)。
應(yīng)用程序數(shù)據(jù)庫-維護(hù)用于序列信息和搜索結(jié)果的本地?cái)?shù)據(jù)庫。
軟件內(nèi)置了破解補(bǔ)丁,安裝完成將“patcher”文件中的所有文件復(fù)制到軟件的安裝目錄下即可自動注冊成為正式版。
標(biāo)簽: Beacon Designer 生物分析 引物設(shè)計(jì)
BioEdit(序列對比分析軟件) V7.0.9.0 官方版 12.59M | 簡體中文 | 6
下載Primer Premier5破解版 32/64位 永久免費(fèi)版 1.29M | 簡體中文 | 2
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