網(wǎng)友評(píng)分: 1.2分
Discovery Studio2019是一款非常專業(yè)的分子建模軟件。該冉家從最基本的界面和顯示模塊到一些蛋白質(zhì)模擬模塊,藥物發(fā)現(xiàn)和設(shè)計(jì)模塊等等,主要幫助我們來對(duì)不同的生命科學(xué)進(jìn)行模擬研究。
使用CHARMm c41b1進(jìn)行分子力學(xué)(MM)計(jì)算
支持廣泛的電源領(lǐng)域,包括CGenFF,charmm36,charmm27,charmm22,CHARMm,CHARMm-polarH,CFF,MMFF等。
完全支持CHARMM分區(qū)機(jī)制并支持自定義無效定義
使用天生的CHARMm溶劑模型(GB)快速準(zhǔn)確地電離蛋白質(zhì)和殘余pKs。
飲用水的快速溶劑,具有適用于非常大分子系統(tǒng)的可選抗離子
根據(jù)國標(biāo)執(zhí)行任何溶劑明確或最小化溶劑基分子力學(xué)(MM)
基于溶劑進(jìn)行明確的溶劑或分子動(dòng)力學(xué)模擬
為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)添加隱含膜,以便您可以基于場(chǎng)強(qiáng)制定模擬模型。
使用基于CHARMm的對(duì)接引擎CDOCKER來執(zhí)行基于配體的配體結(jié)合和精煉對(duì)接。
DS Protein Health
蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)合理性評(píng)價(jià)工具。Protein Health模塊運(yùn)用Profiles 3D方法,通過將三維結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)環(huán)境與特定氨基酸殘基的優(yōu)先外界環(huán)境相比較,獲得相關(guān)結(jié)構(gòu)性質(zhì)與氨基酸序列信息之間的關(guān)系。通過Protein Health模塊的分析,用戶可以方便快速地找到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中不合理的區(qū)域。
DS Protein Families
通過分析某一蛋白家族蛋白序列的保守模式以及在三維結(jié)構(gòu)上的保守殘基的位置,可以在分子水平上更好地了解到蛋白功能機(jī)制。Protein Families的簡(jiǎn)單易用的流程(protocols),也可一步步地引導(dǎo)用戶進(jìn)行分析,從蛋白家族的序列或者結(jié)構(gòu)比對(duì),到進(jìn)化蹤跡分析。而進(jìn)化蹤跡分析包括用分層聚類的方法來建立蛋白家族系統(tǒng)樹圖以及把這些得到的功能注釋信息畫到你的三維結(jié)構(gòu)上去。進(jìn)行序列比對(duì)時(shí),允許根據(jù)需要對(duì)比對(duì)結(jié)果添加約束,提高活性部位關(guān)鍵殘基的比對(duì)效果。
把對(duì)應(yīng)的破解補(bǔ)丁復(fù)制到安裝根目錄,重新打開軟件即可。
標(biāo)簽: Discovery Studio 生物學(xué)分析
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