Geneious是一款功能強大的梯形擬合和峰值調(diào)用軟件，能夠幫助用戶輕松快速的生成基因型微衛(wèi)星位點和等位基因列表，提升大家的工作效率。軟件支持序列對比和系統(tǒng)學分析、毗連群、引物設計和克隆和限制性分析等，讓分子生物和生物化學研究更加方便快捷。

【軟件功能】

　　1、NGS分析和基因組學，使用行業(yè)領先的算法，包括TopHat和Velvet，Illumina、PacBio或Torrent讀數(shù)（任何長度、成對端、條形碼）的從頭組裝或參考映射。對數(shù)據(jù)的綜合分析，包括基因組瀏覽器、持續(xù)的可視化、SNP調(diào)用和RNA-Seq表達式分析。

　　2、序列圖和色譜分析，修剪、組裝和查看Sanger排序跟蹤文件，正確的堿基調(diào)用并創(chuàng)建一致的序列。基因預測、模式、翻譯和變異調(diào)用的自動標注?；蛐臀⑿l(wèi)星跟蹤自動梯擬合和峰值調(diào)用和生成等位基因表。

　　3、對齊和樹構(gòu)建，使用包括MAFFT和ClustalW在內(nèi)的可信算法對DNA或蛋白質(zhì)進行成對和多種比對。查看和編輯實時翻譯和突出顯示。使用包括RAxML和PAUP在內(nèi)的同行評審算法構(gòu)建系統(tǒng)樹，并為公開準備的圖形調(diào)整顯示設置。

　　4、分子克隆，查看質(zhì)粒圖，自動注釋矢量并用注釋復制粘貼序列。尋找限制站點、消化、連接和執(zhí)行Golden Gate，Gibson和Gateway克隆。設計引物，找到CRISPR站點并優(yōu)化密碼。在克隆過程中跟蹤歷史和親子后代譜系。

　　5、搜索、共享和自動化，針對NCBI進行批量BLAST，并直接搜索GenBank。使用無縫集成的共享庫集中和協(xié)作數(shù)據(jù)。導入和導出大多數(shù)行業(yè)標準文件格式。建立自動化的工作流程，以提高效率，控制業(yè)務流程，并減少您的研究中的人為錯誤。

　　6、SnapGene文件導出，將SnapGene*.dna序列文件拖放到Geneious中，無縫地導入序列及其注釋和其他元數(shù)據(jù)。

　　7、CRISPR-CPF1特異性評分，自信地選擇最佳CRISPR-CPF1引導RNA位點使用新的特異性評分，這是根據(jù)對您選擇的數(shù)據(jù)庫的非目標分析計算出來的。

　　8、智能NGS導入，只需一個簡單的步驟就可以將任何類型的SAM、BAM、GFF、BED和VCF文件拖放到Geneious中，即使您有不同的樣品和參考序列的混合物。

　　9、CRISPR Cpf1選項，添加了CRISPR-CPF1與5’PAM位點的支持。在A和T豐富序列中找到位點，并在體內(nèi)具有更高的裂解效率。

　　10、RNA-Seq表達分析的火山圖

　　在交互式火山圖中可視化基因表達，可以用來突出和跳轉(zhuǎn)到差異表達基因。