網(wǎng)友評分:
4.4分
snapgene viewer破解版是一款功能強大的生物學分析軟件。該軟件有著良好的界面,節(jié)省了大量的時間和金錢,容易操作的可視化和模擬,提前預測可能發(fā)生的錯誤,并提醒用戶進行改善,整個過程中,每一個操作都會自動記錄。
5.0版增加了新功能和顯示選項,包括成對比對,從Ensembl數(shù)據(jù)庫導入,對定向TOPO®克隆的支持以及用于與參考DNA序列比對的改進工具。
成對對齊:可以通過局部,全局或半全局比對來分析成對的DNA或蛋白質(zhì)序列。
從Ensembl導入:現(xiàn)在可以將來自Ensembl基因組瀏覽器的基因或轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)直接導入SnapGene。
定向TOPO®克隆:一個新的界面可以模擬定向TOPO®克隆到拓撲異構(gòu)酶激活的載體中。
靈活對齊參考:與參考DNA序列比對的界面已得到增強。各種顯示選項的控件更加直觀,并且可以將比對限制在參考序列的指定鏈或區(qū)域內(nèi)。
可拖動的不對齊端:對于已與參考DNA序列部分比對的序列,現(xiàn)在可以將未比對的末端部分拖出并可視化。
AnzaTM酶:Thermo Fisher(Invitrogen)的AnzaTM酶系統(tǒng)已整合到SnapGene的酶數(shù)據(jù)庫中。
DNA到蛋白質(zhì)的比對轉(zhuǎn)換:可以翻譯DNA比對的選定區(qū)域以產(chǎn)生相應的蛋白質(zhì)比對。
比對cDNA的內(nèi)含子注釋:當cDNA與參考基因組DNA序列比對時,該cDNA可用于創(chuàng)建一個特征,其中的缺口被注釋為內(nèi)含子。
一、想象
1、DNA可視化
查看DNA序列的多個視圖。
地圖 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 歷史
自定義酶位點,特征,引物,ORF,DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式。
使用雙鏈模式查看酶位點,具有翻譯,引物和DNA顏色的特征。單鏈模式顯示具有彩色特征的緊湊概覽。
從一系列酶組中選擇。剪切網(wǎng)站可以顯示為數(shù)字或行,按名稱或頻率排序。
按名稱,位置,大小,顏色,方向性或類型對帶注釋的要素列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。
按名稱,長度,顏色,結(jié)合位點,方向性或解鏈溫度對雜交引物列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。
查看DNA構(gòu)建體的自動生成的圖形歷史記錄。祖先序列可以作為單獨的文件恢復
2、大序列支持
瀏覽染色體大小序列。
查看 · 搜索 · 縮放
利用SnapGene的高效數(shù)據(jù)處理功能,掃描具有數(shù)千種注釋功能的大型DNA序列。
使用專有的MICA算法立即在染色體內(nèi)找到序列。
使用多功能控件調(diào)整縮放系數(shù)和顯示區(qū)域。
3、蛋白質(zhì)可視化
查看蛋白質(zhì)序列的多個視圖。
地圖 · 序列 · 屬性 · 特征 · 歷史
自定義區(qū)域,站點,鍵和序列顏色的顯示。
使用具有相關特征的1-或3個字母的氨基酸代碼查看蛋白質(zhì)序列。
查看蛋白質(zhì)的分子量,消光系數(shù),等電點和氨基酸組成??梢詫Φ鞍踪|(zhì)的選定部分進行相同的分析。
按名稱,位置,大小,顏色或類型對帶注釋的功能列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。
查看自動生成的蛋白質(zhì)序列圖形歷史記錄。祖先蛋白質(zhì)或DNA序列可以作為單獨的文件再生。
4、直觀的序列編輯
輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列。
標準編輯 · DNA結(jié)束
進行插入,刪除,替換和大小寫更改。復制并粘貼序列時,會自動傳輸功能。
編輯線性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。
5、序列顏色編碼
將選定的DNA或氨基酸序列設置為十種顏色之一。
給兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見。
6、特征注釋
自動注釋常用功能,或手動注釋新功能。
自動特征檢測 · 手動特征注釋
使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫查找DNA序列中的常見特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫中。
選擇DNA或蛋白質(zhì)序列的一部分,并使用靈活的GenBank兼容控件注釋特征。
二、模擬
1、限制性站點指標
確認限制性網(wǎng)站適合克隆。
獨特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性質(zhì)
以粗體顯示獨特的限制性位點,或選擇自動定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。
不要被愚弄,因為限制性位點被Dam,Dcm或EcoKI甲基化阻斷。SnapGene將自動用星號標記該站點。
利用工具提示來避免有問題的限制網(wǎng)站。
2、限制性克隆
可視化克隆過程的所有方面。
如果您已經(jīng)考慮過程,則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過程存在設計缺陷,則可以捕獲并糾正錯誤。
3、PCR
模擬標準PCR。
使用您自己的引物,或要求SnapGene自動設計引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄中存儲模板和引物。
4、重疊延伸PCR
通過重疊延伸PCR融合片段
最多可組裝八個碎片。選擇要連接的片段及其方向,SnapGene將設計引物。
5、引物定向誘變
使用誘變引物進行定點誘變。
選擇誘變引物,按下按鈕查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。
6、網(wǎng)關®克隆
模擬網(wǎng)關® BP克隆或LR克隆,或兩者在同一時間。
為方便起見,提供了常見的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段,SnapGene將設計引物。
軟件安裝完成后,直接替換SnapGene.exe
默認路徑C:\Program Files (x86)\SnapGene
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