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SnapGene安裝包是一款比筆和紙更容易使用的分子生物學(xué)軟件,該軟件擁有友好的用戶(hù)界面,可以方便、全面地記錄我們經(jīng)常生成的所有結(jié)構(gòu),其中不僅有專(zhuān)門(mén)的克隆工具可確保所有主要分子克隆技術(shù)的快速準(zhǔn)確構(gòu)建設(shè)計(jì),還可以利用它來(lái)幫助用戶(hù)快速的計(jì)劃、可視化和記錄日常分子生物學(xué)程序,并且該版本為Win10破解版,附帶了相對(duì)應(yīng)的破解補(bǔ)丁,可輕輕松松的幫助用戶(hù)免費(fèi)解鎖全部功能,親測(cè)有效。
1、從本站下載解壓后即可獲得snapgene軟件及破解補(bǔ)丁
2、然后雙擊運(yùn)行主程序“Setup.exe”進(jìn)行安裝,選擇安裝路徑,點(diǎn)擊next
3、然后根據(jù)安裝提示選擇許可協(xié)議,點(diǎn)擊i agree
4、再然后選擇安裝附件,用戶(hù)可以根據(jù)需求安裝;
5、安裝完成,點(diǎn)擊finish,先不要打開(kāi)軟件,接下來(lái)破解該軟件
6、將fix中的SnapGene.exe破解文件復(fù)制到安裝目錄中;
默認(rèn)路徑:C:\Program Files (x86)\SnapGene
7、至此,軟件成功破解,以上就是snapgene中文破解版的詳細(xì)安裝教程。
1、In-Fusion 克隆
Clontech 的 In-Fusion 克隆技術(shù)是創(chuàng)建無(wú)縫基因融合的一種非常通用的方法。 這是第一個(gè)模擬此程序的軟件。 只需選擇您想要融合的 DNA 片段,SnapGene 即可設(shè)計(jì)引物。
2、Gibson Assembly?
許多研究人員轉(zhuǎn)向 Gibson 組裝,在不使用限制性酶的情況下將片段插入質(zhì)粒中。待連接的 DNA 片段通過(guò) PCR 擴(kuò)增以產(chǎn)生重疊的末端。SnapGene 簡(jiǎn)化了Gibson組裝反應(yīng)的計(jì)劃,并自動(dòng)化了引物設(shè)計(jì)。
3、限制性克隆
獨(dú)特的限制克隆界面以干凈的布局顯示您需要的信息。克隆程序的規(guī)劃從來(lái)沒(méi)有這么簡(jiǎn)單過(guò)。如果你已經(jīng)知道你想做什么,克隆模擬只需要幾秒鐘。如果克隆過(guò)程存在設(shè)計(jì)缺陷,則可以在模擬過(guò)程中捕獲并糾正錯(cuò)誤。
4、聚合酶鏈反應(yīng)與誘變
設(shè)計(jì)引物后,它們可以用來(lái)模擬常規(guī) PCR、重疊延伸 PCR 或誘變。得到的DNA序列文件可立即用于進(jìn)一步操作。與限制克隆界面一樣,以引物為中心的界面以直觀的方式顯示關(guān)鍵信息。
5、自動(dòng)保存
最令人驚訝的是它自動(dòng)記錄了克隆項(xiàng)目中的步驟。每次編輯序列或模擬克隆、PCR 或誘變時(shí),程序都會(huì)自動(dòng)記錄在圖形歷史中。在模擬 DNA 構(gòu)建體的創(chuàng)建之后,您可以使用歷史作為實(shí)驗(yàn)方案。
6、瓊脂糖凝膠電泳
napGene 使用一種先進(jìn)的算法來(lái)創(chuàng)建真實(shí)的瓊脂糖凝膠模擬。限制性片段以三種形式顯示:模擬凝膠、數(shù)值列表和序列圖。您可以使用模擬凝膠計(jì)劃診斷限制摘要,或?qū)?shí)際凝膠圖像與預(yù)測(cè)模式進(jìn)行比較。
7、酶位點(diǎn)
SnapGene 以清晰的方式突出限制位點(diǎn),自動(dòng)標(biāo)記甲基化阻斷的位點(diǎn)。簡(jiǎn)單的控制可以讓你選擇有用的酶組,比如“獨(dú)特的切割器”,或者定義自定義酶組和首選供應(yīng)商。信息工具提示提供關(guān)鍵數(shù)據(jù)。“限制酶”窗口顯示了數(shù)百種商用酶的詳細(xì)特性。
1、首先第一步我們打開(kāi)snapgene軟件界面之后,找到序列所在的TXT文件,將他拖動(dòng)到軟件界面中。
2、之后下一步軟件就會(huì)自動(dòng)識(shí)別到TXT文件中的每一個(gè)序列,識(shí)別之后會(huì)將其分成一些單獨(dú)的序列文件,然后我們點(diǎn)擊出現(xiàn)的界面中的Import這個(gè)按鈕。
3、點(diǎn)擊這個(gè)按鈕之后軟件會(huì)自動(dòng)生成一個(gè)文件夾,然后其中就包括了TXT文件中的每一個(gè)序列,我們點(diǎn)擊打開(kāi)一個(gè)序列之后右鍵鼠標(biāo)點(diǎn)擊它,然后在出現(xiàn)的選項(xiàng)選擇Align Multiple Sequences這個(gè)選項(xiàng)。
4、點(diǎn)擊之后會(huì)彈出下圖所示的一個(gè)窗口,然后我們選中其他的想要對(duì)比的序列文件,全部選中之后點(diǎn)擊打開(kāi)按鈕。
5、點(diǎn)擊打開(kāi)之后就會(huì)自動(dòng)進(jìn)行對(duì)比,并且將對(duì)比的結(jié)果顯示到下方的Map標(biāo)簽頁(yè)當(dāng)中,我們可以看到每一個(gè)顏色的序列,表示的意思都是不同的。
6、最后我們點(diǎn)擊下方的snapgene標(biāo)簽頁(yè),然后就可以看到更加具體的對(duì)比信息結(jié)果。
1、質(zhì)粒圖譜
以pUC57質(zhì)粒為例,怎樣畫(huà)出其質(zhì)粒圖譜呢?
首先我們?cè)贜CBI上下載pUC57的FASTA序列。打開(kāi)SnapGene,選擇第一個(gè)功能New DNA File,將序列粘貼進(jìn)去后,點(diǎn)擊【OK】。
(這里由于是環(huán)狀質(zhì)粒,所以選擇了默認(rèn)的Circular)軟件自動(dòng)識(shí)別除了9個(gè)通用的元件,包括氨芐抗性基因(AmpR)、lac操縱子、復(fù)制起點(diǎn)(ori)等,點(diǎn)擊【Add 9 features】,進(jìn)入SnapGene的主界面。
進(jìn)入主界面后,可以看到上面一排是工具欄,下面是幾個(gè)界面,對(duì)應(yīng)的功能如下:
le data-draft-node="block" data-draft-type="table" data-size="normal" data-row-style="normal">
2、質(zhì)粒圖譜的具體編輯方法
(1)序列標(biāo)注
由于之前打開(kāi)序列文件的時(shí)候,軟件自動(dòng)識(shí)別出了9個(gè)常見(jiàn)的元件,所以也同時(shí)自動(dòng)生成了載體圖譜。而當(dāng)我們點(diǎn)擊Sequece界面時(shí),也可以看到相應(yīng)的元件已經(jīng)標(biāo)注在序列上了。
當(dāng)然我們也可以自己編輯,雙擊lacZa的文字即可進(jìn)入feature編輯界面,可以編輯序列名稱(chēng)、方向、范圍以及顏色等信息,編輯完成后點(diǎn)【OK】,Sequence界面就會(huì)出現(xiàn)相應(yīng)的序列注釋信息。
如果我們要新添加一段序列注釋?zhuān)瑒t選擇相應(yīng)序列,點(diǎn)擊工具欄【Features】—【Addfeature】,同樣會(huì)進(jìn)入Feature編輯界面。
?。?)設(shè)計(jì)引物
我們可以直接在序列上添加引物,當(dāng)我們選中一段序列后,軟件會(huì)直接給出序列長(zhǎng)度和Tm值,可以據(jù)此調(diào)整引物序列。
點(diǎn)擊工具欄中的【Primers】—【Add primers】,進(jìn)入引物編輯界面,可設(shè)計(jì)正向或者反向引物,編輯好引物名稱(chēng)后點(diǎn)擊【Add Primers to Template】,即可在Sequence界面看到編輯好的引物序列。
?。?)圖譜導(dǎo)出
單擊工具欄【File】—【Export】—【Map】,即可導(dǎo)出質(zhì)粒圖譜,支持多種格式,包括常見(jiàn)的圖片格式TIFF、PNG等,也可以生成PDF文檔。
3、序列對(duì)比
序列比對(duì)的軟件有很多,SnapGene用于序列比對(duì)的優(yōu)勢(shì)在于其序列是雙向的,比對(duì)時(shí)不用考慮序列方向問(wèn)題。
操作也比較簡(jiǎn)單,左側(cè)工具條最下方的按鈕就是序列比對(duì),點(diǎn)擊后導(dǎo)入需要比對(duì)的序列即可。比對(duì)結(jié)果中比對(duì)不上的地方用紅色標(biāo)注。
另外SnapGene也支持測(cè)序文件導(dǎo)入(.abi文件),例如我們先打開(kāi)一個(gè)參考序列,再通過(guò)序列比對(duì)按鈕將需要比對(duì)的測(cè)序文件都打開(kāi),就能獲得多序列比對(duì)的結(jié)果,點(diǎn)擊左側(cè)序列則能直接查看峰圖,非常方便。
結(jié)語(yǔ):
關(guān)于軟件的基本用法就先介紹到這里,其實(shí)SnapGene還有很多強(qiáng)大的功能,比如Tools工具中的模擬電泳,Actions工具中的模擬Gateway和infusion克隆等。在此不做進(jìn)一步的介紹,如果有需要可收藏本站。
標(biāo)簽: SnapGene 生物分析 分子生物學(xué)
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